La région du Morvan, en particulier le massif granitique, constitue une très grande aire géographique au sein de laquelle la Préhistoire reste encore très mal connue. L'état des connaissances est assez différent entre le massif du Morvan et les vallées adjacentes du Serein, de l'Arroux, de l'Aleine et de l'Yonne. L'industrie lithique de quelques sites du haut Morvan a permis de mettre en évidence une première fréquentation mésolithique et plusieurs sites de hauteur occupés à partir du Néolithique moyen et au Néolithique final, dont une probable enceinte du Néolithique moyen sur le Mont Beuvray. Des études complémentaires dans la vallée de l'Arroux permettent de confirmer l'important développement de l'habitat et l'érection de menhirs au Néolithique moyen. Les découvertes concernant le Néolithique final semblent moins nombreuses et plus ponctuelles. Les trop rares indices culturels permettent d'évoquer la présence du Chasséen, du Néolithique Moyen Bourguignon, de plusieurs groupes du Néolithique final et du Campaniforme, aussi bien dans le haut Morvan que dans les vallées périphériques du massif