Les notions de corridors, de trames ou de continuités écologiques occupent aujourd'hui une place prépondérante dans les politiques de conservation de la nature dont elles constituent le troisième et dernier temps, celui du réseau écologique (Bonnin, 2008). Apparues au milieu des années 1980, ces notions ont depuis lors significativement infléchi les modalités de l'action publique environnementale en substituant ou en superposant à une approche mono-scalaire par le site et le zonage, une démarche multi-échelle par le réseau. Ces mutations du cadre de référence de la conservation et des objectifs associés suscitent de nombreuses interrogations quant à leur opérationnalité. Il s'agit en effet de repenser un appareillage conceptuel et méthodologique impliquant de nouveaux acteurs et devant désormais s'appliquer à toutes les échelles du territoire, du réseau écologique continental au document d'urbanisme local. Nous exposons comment, face à ces enjeux, la géographie, la géomatique et l'écologie peuvent, ensemble, contribuer à ce renouvellement méthodologique. En mobilisant une étude de cas réalisée dans le cadre du projet de recherche AMELI actuellement en cours, nous proposons un protocole exploratoire qui vise explicitement à articuler les expertises techniques, scientifiques et habitantes.