Grâce à un financement de l'ANR a pu être édité sur un site dédié (http://www.dossiers-flaubert.fr/) un ensemble patrimonial fragile et complexe (mélangeant les supports manuscrits, imprimés et mixtes), d'importance scientifique et culturelle reconnue: les dossiers documentaires constitués par Flaubert en vue de la rédaction de son dernier roman, Bouvard et Pécuchet, conservés aujourd'hui à la bibliothèque municipale de Rouen sous la forme de huit recueils de documents divers auxquels s'ajoutent deux recueils concernant le Dictionnaire des idées reçues, soit 2400 feuillets. La mise à disposition sur Internet (sous forme d'images et de transcriptions) de ce corpus auparavant très difficile d'accès s'accompagne d'un enrichissement scientifique conséquent (moteur de recherche, métadonnées, annotations et bibliothèques) dont le point d'orgue est un dispositif informatique original permettant de créer des agencements paramétrables de citations extraites des documents édités. Les internautes peuvent ainsi produire, entre autres agencements, des reconstitutions conjecturales du second volume de Bouvard et Pécuchet, un volume dont Flaubert avait partiellement conçu le plan et commencé à réunir la matière mais que la mort l'a empêché de rédiger.
Grâce à l'encodage XML-TEI intégral du corpus, le site propose à la fois une édition en ligne multi-format et un outil de production d'agencement de citations. Transcrit par l'équipe scientifique du projet, le corpus a été encodé en XML-TEI, un langage informatique libre et ouvert qui s'attache à décrire la structure logique des documents et à en identifier les différents éléments constitutifs. Ce choix permet de proposer sur le site d'édition, à partir d'un même fichier numérique, plusieurs types de visualisation pour chaque document. Il offre aussi une réponse technique à l'autre versant du projet visant à produire des reconstitutions conjecturales du second volume de Bouvard et Pécuchet: il a permis de découper virtuellement le corpus en fragments textuels autonomes (selon la logique que Flaubert avait déjà partiellement mise en œuvre en vue de la rédaction de son " encyclopédie critique en farce "), tout en veillant à ce que chaque fragment reste relié à la fois à la zone d'image dont il présente la transcription et aux différentes unités textuelles dont il est partie prenante (comme la page où se situe le fragment). Stockés dans une base de données relationnelle, les fragments peuvent être convoqués et organisés selon diverses hypothèses de recherche. Les agencements de citations produits (les seconds volumes possibles) sont exportables au format XML ou PDF.