Pearl millet genome sequence provides a resource to improve agronomic traits in arid environments
La séquençage du génome du millet perlé fournit une ressource pour améliorer les caractères agronomiques en milieux arides
Résumé
Abstract Pearl millet [ Cenchrus americanus (L.) Morrone] is a staple food for more than 90 million farmers in arid and semi-arid regions of sub-Saharan Africa, India and South Asia. We report the ∼1.79 Gb draft whole genome sequence of reference genotype Tift 23D 2 B 1 -P1-P5, which contains an estimated 38,579 genes. We highlight the substantial enrichment for wax biosynthesis genes, which may contribute to heat and drought tolerance in this crop. We resequenced and analyzed 994 pearl millet lines, enabling insights into population structure, genetic diversity and domestication. We use these resequencing data to establish marker trait associations for genomic selection, to define heterotic pools, and to predict hybrid performance. We believe that these resources should empower researchers and breeders to improve this important staple crop.
Le millet perlé [Cenchrus americanus (L.) Morrone, syn. Pennisetum glaucum] est un aliment de base pour plus de 90 millions d'agriculteurs dans les régions arides et semi-arides de l'Afrique subsaharienne, de l'Inde et de l'Asie du Sud. Nous rendons compte des résultats du projet de séquençage du génome entier de ~1.79 Gb du génotype de référence Tift 23D2B1-P1-P5 contenant environ 38.579 gènes. Nous soulignons l'enrichissement substantiel en gènes de biosynthèse de la cire, qui peuvent contribuer à la tolérance à la chaleur et à la sécheresse de cette céréale. Nous avons reséquencé et analysé 994 lignées de millet perlé, ce qui nous a permis de mieux appréhender la structure des populations, la diversité génétique et le processus de domestication. Nous utilisons ces données de reséquençage pour établir des associations de marqueurs utiles à la sélection génomique, pour définir des pools hétérotiques et pour prédire la performance des hybrides. Nous pensons que ces ressources devraient permettre aux chercheurs et aux sélectionneurs d'améliorer les performances de cette agriculture vivrière.
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