New evidence of a mitochondrial genetic background paradox: impact of the J haplogroup on the A3243G mutation.
Denis Pierron
(1, 2)
,
Christophe Rocher
(2)
,
Patricia Amati-Bonneau
(3)
,
Pascal Reynier
(3)
,
Marie-Laure Martin-Négrier
(4)
,
Stéphane Allouche
(5)
,
Cécile Batandier
(6)
,
Benedicte Mousson de Camaret
,
Catherine Godinot
(7)
,
Agnes Rotig
(8)
,
Delphine Feldmann
(9)
,
Christine Bellanne-Chantelot
(10)
,
Benoit Arveiler
(11)
,
Erwann Pennarun
(12)
,
Rodrigue Rossignol
(2)
,
Marc Crouzet
,
Pascal Murail
(1)
,
Didier Thoraval
(13)
,
Thierry Letellier
(2)
1
PACEA -
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
2 Physiopathologie mitochondriale
3 Mitochondrie : Régulations et Pathologie
4 Laboratoire d'Anatomie Pathologique
5 BMCS - Biologie moléculaire et cellulaire de la signalisation
6 Bioénergétique fondamentale et appliquée
7 CGPhiMC - Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire
8 Inserm U393 - Handicaps génétiques de l'enfant
9 CHU Trousseau [APHP]
10 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
11 Laboratoire de Génétique Humaine, Développement et Cancer
12 Department of Evolutionary Biology
13 IBGC - Institut de biochimie et génétique cellulaires
2 Physiopathologie mitochondriale
3 Mitochondrie : Régulations et Pathologie
4 Laboratoire d'Anatomie Pathologique
5 BMCS - Biologie moléculaire et cellulaire de la signalisation
6 Bioénergétique fondamentale et appliquée
7 CGPhiMC - Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire
8 Inserm U393 - Handicaps génétiques de l'enfant
9 CHU Trousseau [APHP]
10 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
11 Laboratoire de Génétique Humaine, Développement et Cancer
12 Department of Evolutionary Biology
13 IBGC - Institut de biochimie et génétique cellulaires
Denis Pierron
Connectez-vous pour contacter l'auteur
- Fonction : Auteur correspondant
- PersonId : 864816
Connectez-vous pour contacter l'auteur
Pascal Reynier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756831
- ORCID : 0000-0003-0802-4608
- IdRef : 087662094
Cécile Batandier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1208809
- IdHAL : cecile-batandier
- ORCID : 0000-0003-1173-458X
- IdRef : 144886456
Benedicte Mousson de Camaret
- Fonction : Auteur
Marc Crouzet
- Fonction : Auteur
Résumé
Background: The A3243G mutation in the tRNALeu gene (UUR), is one of the most common pathogenic mitochondrial DNA (mtDNA) mutations in France, and is associated with highly variable and heterogeneous disease phenotypes. To define the relationships between the A3243G mutation and mtDNA backgrounds, we determined the haplogroup affiliation of 142 unrelated French patients – diagnosed as carriers of the A3243G mutation – by control-region sequencing and RFLP survey of their mtDNAs. Results: The analysis revealed 111 different haplotypes encompassing all European haplogroups, indicating that the 3243 site might be a mutational hot spot. However, contrary to previous findings, we observed a statistically significant underepresentation of the A3243G mutation on haplogroup J in patients (p = 0.01, OR = 0.26, C.I. 95%: 0.08–0.83), suggesting that might be due to a strong negative selection at the embryo or germ line stages. Conclusion: Thus, our study supports the existence of mutational hotspot on mtDNA and a "haplogroup J paradox," a haplogroup that may increase the expression of mtDNA pathogenic mutations, but also be beneficial in certain environmental contexts.
Format du dépôt | Notice |
---|---|
Type de dépôt | Article dans une revue |
Titre |
en
New evidence of a mitochondrial genetic background paradox: impact of the J haplogroup on the A3243G mutation.
|
Résumé |
en
Background: The A3243G mutation in the tRNALeu gene (UUR), is one of the most common pathogenic mitochondrial DNA (mtDNA) mutations in France, and is associated with highly variable and heterogeneous disease phenotypes. To define the relationships between the A3243G mutation and mtDNA backgrounds, we determined the haplogroup affiliation of 142 unrelated French patients – diagnosed as carriers of the A3243G mutation – by control-region sequencing and RFLP survey of their mtDNAs. Results: The analysis revealed 111 different haplotypes encompassing all European haplogroups, indicating that the 3243 site might be a mutational hot spot. However, contrary to previous findings, we observed a statistically significant underepresentation of the A3243G mutation on haplogroup J in patients (p = 0.01, OR = 0.26, C.I. 95%: 0.08–0.83), suggesting that might be due to a strong negative selection at the embryo or germ line stages. Conclusion: Thus, our study supports the existence of mutational hotspot on mtDNA and a "haplogroup J paradox," a haplogroup that may increase the expression of mtDNA pathogenic mutations, but also be beneficial in certain environmental contexts.
|
Auteur(s) |
Denis Pierron
1, 2
, Christophe Rocher
2
, Patricia Amati-Bonneau
3
, Pascal Reynier
3
, Marie-Laure Martin-Négrier
4
, Stéphane Allouche
5
, Cécile Batandier
6
, Benedicte Mousson de Camaret
, Catherine Godinot
7
, Agnes Rotig
8
, Delphine Feldmann
9
, Christine Bellanne-Chantelot
10
, Benoit Arveiler
11
, Erwann Pennarun
12
, Rodrigue Rossignol
2
, Marc Crouzet
, Pascal Murail
1
, Didier Thoraval
13
, Thierry Letellier
2
1
PACEA -
De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
( 205557 )
- Université de Bordeaux - Bâtiment B8 - CS50023 - Allée Geoffroy-Saint-Hilaire - 33615 Pessac Cedex
- France
2
Physiopathologie mitochondriale
( 3046 )
- 146, Rue Leo Saignat 33076 BORDEAUX CEDEX
- France
3
Mitochondrie : Régulations et Pathologie
( 3052 )
- CHU 4, Rue Larrey 49033 Angers Cedex
- France
4
Laboratoire d'Anatomie Pathologique
( 104355 )
- Laboratoire d'Histologie-Embryologie, UFRII, Université Victor Segalen Bordeaux 2, 33076 Bordeaux, France
- France
5
BMCS -
Biologie moléculaire et cellulaire de la signalisation
( 108052 )
- Université de CAEN
- France
6
Bioénergétique fondamentale et appliquée
( 29565 )
- Université Joseph Fourier Bat B BP53 38041 Grenoble Cedex 9
- France
7
CGPhiMC -
Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire
( 711 )
- bat. 741 43 Bvd du 11 Novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX
- France
8
Inserm U393 -
Handicaps génétiques de l'enfant
( 20174 )
- GH Necker 149, rue de Sèvres 75743 Paris cedex 15
- France
9
CHU Trousseau [APHP]
( 360410 )
- 26 Avenue du Dr Arnold Netter, 75012 Paris
- France
10
CHU Saint-Antoine [AP-HP]
( 454982 )
- 184, rue du Faubourg Saint-Antoine
75571 Paris cedex 12
- France
11
Laboratoire de Génétique Humaine, Développement et Cancer
( 32535 )
- Bordeaux
- France
12
Department of Evolutionary Biology
( 104357 )
- , University of Tartu and Estonian Biocentre, Tartu
- Estonie
13
IBGC -
Institut de biochimie et génétique cellulaires
( 588 )
- 1 Rue Camille Saint-Saens 33077 BORDEAUX CEDEX
- France
|
Comité de lecture |
Oui
|
Vulgarisation |
Non
|
Langue du document |
Anglais
|
Nom de la revue |
|
Audience |
Internationale
|
Date de publication |
2008
|
Volume |
9:41
|
Page/Identifiant |
1-13 (page number not for citation purposes)
|
Domaine(s) |
|
Mots-clés |
en
pathogenic mitochondrial DNA, pathogenic mutations, tRNALeu gene
|
DOI | 10.1186/1471-2350-9-41 |
PubMed Central | PMC2409300 |
Loading...