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Article dans une revue Bulletins et Mémoires de la Société d'anthropologie de Paris Année : 2023

beDNA: A project for systematic collection of archaeological human samples for palaeogenetics purposes – first trial

beDNA : un projet visant à la collection systématique d’échantillons humains archéologiques à vocation paléogénétique – une première expérimentation

Résumé

Palaeogenetics is becoming increasingly impor-tant in tackling archaeological issues. However, analyses of ancient DNA can be hampered or even prevented by the state of preservation of samples due to poor storage conditions, and because of contamination by modern DNA. The beDNA project for a national archaeological genetic data and sample bank (banque d’échantillons et de Données Nationale Archéo- génétique) is developing the means to enable future palae-ogenetic analyses by systematically storing human skeletal samples, with the constraints inherent to the preservation of ancient DNA taken into account. This project comprises (1) a systematic protocol for “clean” sampling of human remains to be common to all archaeological operations, (2)a dedicated storage space for samples, suited to aDNA preservation, (3) a database linking sites with the samples stored in the bank, (4) approval of sample analysis requests by authorities, after expert review. The test phase of the project, which began in September 2020 in the Île-de-France region, enabled us to evaluate and adjust both the sampling protocol in the field and the transfer process to the beDNA bank. This note describes the different stages envisaged for each sample, from the archaeological field to the genetics laboratory, as well as the development of the experimental phase and initial feedback from it.
La paléogénétique occupe désormais une place importante dans les problématiques archéologiques. Toute-fois, les analyses d’ADN ancien peuvent être desservies, voire empêchées, par l’état de préservation des échantillons en raison de contamination par de l’ADN moderne ou de mauvaises conditions de stockage. Le projet beDNA, “banque d’échantillons et de Données Nationale Archéo-génétique”, souhaite donner les moyens d’analyses paléo-génétiques futures, en proposant le stockage systématique d’échantillons des squelettes humains tenant compte des contraintes inhérentes à la préservation de l’ADN ancien. Le projet implique (1) un protocole systématique d’échantil-lonnage “propre” des restes humains sur le terrain commun à toutes les opérations archéologiques, (2) un espace de stockage dédié à ces échantillons adapté à la conservation de l’ADN ancien, (3) une base de données faisant le lien entre les sites et les échantillons conservés dans la banque, (4) l’approbation par l’État des demandes d’analyse d’échan-tillons après expertise. La phase de test du projet, initiée en septembre 2020 sur la région Île-de-France, nous a permis d’évaluer et d’ajuster le protocole d’échantillonnage sur le terrain et les dispositifs de transfert vers la banque. Cette note présente les étapes envisagées pour chaque échantillon, depuis les terrains jusqu’aux laboratoires d’analyse géné-tique, ainsi que le déroulement de sa phase test, en cours, et les premiers retours d’expérience.
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Dates et versions

halshs-04389666, version 1 (11-01-2024)
halshs-04389666, version 2 (11-01-2024)

Identifiants

Citer

Pauline Ehrhardt, Philippe Chambon, Eric Gimel, Evelyne Heyer, Sophie Lafosse, et al.. beDNA : un projet visant à la collection systématique d’échantillons humains archéologiques à vocation paléogénétique – une première expérimentation. Bulletins et Mémoires de la Société d'anthropologie de Paris, 2023, 35 (1), ⟨10.4000/bmsap.11516⟩. ⟨halshs-04389666v2⟩
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Dernière date de mise à jour le 26/06/2024
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