Les arrêts rendus par la Cour des comptes portant sur la responsabilité personnelle et pécuniaire de l'agent comptable ont le mérite d'éclairer certaines pratiques budgétaires et comptables des universités ayant accédé aux responsabilités et compétences élargies (RCE) depuis la loi LRU de 2007. Ces pratiques sont appelées à évoluer avec l'application depuis 2016 aux 2016 aux EPSCP du décret GBCP de 2012 notamment au niveau de la transparence de la gestion des universités et de la responsabilité de leurs gestionnaires publics (ordonnateur et comptable). Il en va de la réussite de la “nouvelle université” créée sous forme d'établissement public expérimental (EPE) institué par l'ordonnance Vidal du 12 décembre 2018.