L’anthropologie présente dans les Pensées de Pascal est surtout connue pour la tripartition corps/intelligence/cœur, qui conduit à la célèbre théorie des trois ordres. Il n’y a pas chez Pascal apparemment de réflexion spécifique sur la notion d’âme, à l’instar de ses grands contemporains – notamment Descartes. Il reste que l’âme, sans faire l’objet d’aucune thématisation, appartient bien au vocabulaire des Pensées, comme énigme plutôt que comme catégorie philosophique ou spirituelle. L’âme est à la fois nécessaire et introuvable. Il n’est pas concevable qu’un chrétien convaincu comme Pascal fasse l’économie de cette notion, ni encore moins qu’il la mette en doute. Mais ses tentatives pour lui donner un contenu butent sur différentes apories. En bon scientifique, Pascal tente le chemin de l’analyse, qui le conduit logiquement à une anatomie. Mais celle-ci demeure infructueuse. Au terme de l’anatomie, l’âme reste indicible. Il faut donc se résigner à une enquête indirecte, et traquer l’âme dans les effets qu’elle laisse parfois paraître. Plutôt qu’à une définition de l’âme, le parcours de Pascal nous conduit à une pratique. Il n’est pas possible d’accéder à l’âme en dehors d’une certaine logique d’amour.L'âme est enfin proprement en l'homme le lieu de la grandeur, ce en quoi il est mystérieusement permis en lui d'assigner la grandeur. L'âme pascalienne recouvre trois principes : de perpétuation, d'individuation, de grandeur.